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[IT뉴스]아토매트릭스, 설립 1년 만에 PCCP 논문 2편 연속 게재

온카뱅크관리자

2025-12-17 19:27:31

<div id="layerTranslateNotice" style="display:none;"></div>  <strong class="summary_view" data-translation="true">KRAS G12D·PCSK9-LDLR 구조·동역학 규명<br>TIPS 선정·CDA·MOU 11건, 2026년 플랫폼 출시</strong> 
        <div class="article_view" data-translation-body="true" data-tiara-layer="article_body" data-tiara-action-name="본문이미지확대_클릭"> 
         <section dmcf-sid="5Bapiou5IS">
          <figure class="figure_frm origin_fig" contents-hash="e11fbaaf9ebf7f260e11fd5ed3ba47a1446d283a5b1a06894c4fd85f9b7b9f65" dmcf-pid="1bNUng71sl" dmcf-ptype="figure">
           <p class="link_figure"><img class="thumb_g_article" data-org-src="https://t1.daumcdn.net/news/202512/17/etimesi/20251217192606594jzgy.png" data-org-width="547" dmcf-mid="Z0czgjB3Iv" dmcf-mtype="image" height="auto" src="https://img1.daumcdn.net/thumb/R658x0.q70/?fname=https://t1.daumcdn.net/news/202512/17/etimesi/20251217192606594jzgy.png" width="658"></p>
          </figure>
          <p contents-hash="470d92ef75c58d28b10064d417e78454973c6f6187b69f3b6e84f1b9d5ae70be" dmcf-pid="tKjuLaztDh" dmcf-ptype="general">인공지능(AI)·분자동역학(MD) 기반 신약개발 스타트업 아토매트릭스(대표 이은호)가 설립 1년 만에 물리화학 분야 국제 학술지 '물리화학 및 화학물리학(Physical Chemistry Chemical Physics)'에 핵심 연구 2편을 연이어 게재했다.</p>
          <p contents-hash="8291b49fcd1532b99150d5301b34deea371a05b8d4d9745636c81bf8c2f5dbf6" dmcf-pid="F9A7oNqFDC" dmcf-ptype="general">이번 연구는 아토매트릭스의 인실리코 신약설계 플랫폼 'CANDDIE' 핵심 모듈을 실제 질환 표적에 적용해 얻은 성과로 제시됐다. CANDDIE는 결합 친화도 예측 모듈 BARon과 약리 신호전달 예측 모듈 Allopiper를 기반으로 표적 단백질의 결합·조절 기전을 구조·동역학 관점에서 분석하는 구성을 갖췄다.</p>
          <p contents-hash="ee3b3451ac58e1332327adbb285aeb1f2c14326b03e8a5cd96a45a9f3bead518" dmcf-pid="32czgjB3OI" dmcf-ptype="general">첫 번째 논문은 김동환 박사가 제1저자로 참여한 '다수의 결정구조에 대한 분자동역학 시뮬레이션을 통해 밝혀낸 KRAS G12D 억제제 결합의 기전적 통찰(Mechanistic Insights into KRAS G12D Inhibitor Binding Revealed by Molecular Dynamics Simulations of Multiple Crystal Structures)'이다. 난치암의 주요 원인 돌연변이로 알려진 KRAS G12D 억제제가 표적에 결합하는 과정을 분자동역학 시뮬레이션으로 추적해 결합 메커니즘을 규명했다. 다수의 결정구조를 바탕으로 결합 양상 변화를 비교·분석했다는 점에서 고난도 암 표적 약물 설계의 정밀도 향상과 연결되는 결과로 제시됐다.</p>
          <p contents-hash="8161920e8f7e6c64a0b1ce0006bfb2135ce2984671a8e0a442be25b277ebe9e3" dmcf-pid="0VkqaAb0IO" dmcf-ptype="general">두 번째 논문은 백용수 박사가 제1저자로 참여한 'PCSK9-LDLR 상호작용의 알로스테릭 억제: 소분자 설계를 위한 구조적 통찰(Allosteric inhibition of the PCSK9-LDLR interaction: structural insights for small molecule design)'이다. 콜레스테롤 대사 조절 단백질 PCSK9의 알로스테릭 조절 기전을 구조적으로 해석하고, PCSK9-LDLR 상호작용을 표적으로 하는 소분자 설계 단서를 도출했다. 경구용 고지혈증 치료제 개발을 위한 구조 기반 설계 전략의 확장 가능성을 제시한 연구로 정리됐다.</p>
          <p contents-hash="57b29eb9845f2b53c92d5000a086aed37a02a546947dd1edae073b5126542093" dmcf-pid="pfEBNcKpIs" dmcf-ptype="general">아토매트릭스는 중소벤처기업부가 설립하고 창업진흥원·경기창조경제혁신센터가 운영하는 판교 창업존 입주 기업이다. 2024년 5월 설립 이후 1년 만에 TIPS에 선정됐고, 올해 서울바이오허브-대원제약 오픈이노베이션 프로그램 참여 기업으로도 이름을 올렸다. 국내외 제약사와 비밀유지계약(CDA) 9건, 업무협약(MOU) 2건을 체결하며 협력 네트워크도 확대한다.</p>
          <p contents-hash="b9425b412d2e3a4a37a8a3ea49ed583da3b504997bc80daf8ef423975902a3ef" dmcf-pid="UPm2kwfzmm" dmcf-ptype="general">제품화 로드맵도 제시했다. 올해 제주에서 열린 비임상학회에서 CANDDIE 알파 버전을 처음 공개했고, 사용자 의견을 반영해 지난 3월 베타 버전 무료 배포를 예고했다. 2026년 6월 공식 출시를 목표로 AI와 분자동역학(MD)을 통합한 서비스형 소프트웨어(SaaS) 기반 컴퓨터 기반 약물 설계(CADD) 플랫폼 개발에 속도를 내고 있다.</p>
          <p contents-hash="5c4eaef473caaec649e76f8eb59dfe12a7c86c9d02934247e5425b214641980a" dmcf-pid="uQsVEr4qDr" dmcf-ptype="general">이은호 대표는 “세계적 학술성과와 산업 협력 성과를 동시에 달성한 것은 CANDDIE 플랫폼의 실전성을 입증한 결과”라며 “AI와 실험을 지능적으로 연결해 신약개발의 새로운 표준을 만들겠다”고 말했다.</p>
          <p contents-hash="56b7349ed17be1883283bd68027d22e009d67fee33b539a49fbb2a49e8be40bd" dmcf-pid="7xOfDm8Bmw" dmcf-ptype="general">판교 창업존은 2017년 조성된 창업지원 클러스터로, 입주 기업에 액셀러레이팅·투자 유치·사업화 프로그램 등을 연계해 판교 창업 생태계의 거점 역할을 수행하고 있다.</p>
          <p contents-hash="4cf742b5215dd90e3243244ed4bf60f9e7bd63ce2a22cbd6d2235d581e8749a7" dmcf-pid="zMI4ws6bwD" dmcf-ptype="general">성남=김동성 기자 estar@etnews.com</p>
         </section> 
        </div> 
        <p class="" data-translation="true">Copyright © 전자신문. 무단전재 및 재배포 금지.</p>

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